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核酸检测PCR试剂盒设计引物应遵循以下原则

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更新: 2023-02-08
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公司基本资料信息
 
   反应五要素:
  参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
  引物:引物是PCR特异性反应的关键,PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。设计引物应遵循以下原则:
  ①引物长度:5-30bp,常用为20bp左右。
  ②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至0kb的片段。
  ③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
  ④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。
  ⑤引物3'端的碱基,特别是末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。
  ⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。
  ⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。
  引物量:每条引物的浓度0.~umol或0~00pmol,以低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。
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